前に比べて簡単にできるようになっていると思います
inkscape 0.48ぐらいだとちょっと難しかった
フィル/ストローク両方とも赤色にしてもこんなふうになります
矢印のところだけ、何色を選んでも黒になるという
矢印のところも変更するには、メニューの「エクステンション」→「パスの変形」→「マーカーの色をパスに合わせる」を実行する必要がありました
Linuxブログ : inkscape 0.48で矢印の色を変更する
0.91だとかんたんになった気がする
1.ペンツールで線を書く
2.フィル/ストロークで「ストロークのスタイル」→「マーカー」で一番右端の項目(たぶん終点)を選ぶ
3.フィル/ストロークの色を両方とも同じ色(例では赤色)にする
と、矢印全部が赤色になります(∩´∀｀)∩ﾜｰｲ
これでinkscapeで矢印がバシバシ引けますね！
こういう地味に使いやすくなる改良は良いかと思います。
※試したinkscape 0.91はプレビュー版なので、正式版では変更になる可能性があります